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• 上海交通大学档案馆 - 1986年4月12日成立，设有馆长室、办公室、档案业务指导监督室、档案保管利用室、档案科学及史料应用研究室等五个室。
• 东南大学档案馆 - 成立于1986年10月20日，现有编制21人，设文书档案室、科技档案室、电子文件与技术室、人事档案室和学生档案室。
• 中国人民大学档案馆 - 建于1954年3月，1995年3月重新建馆，设有文书档案、科技档案、人事档案三个室。
• 中国农业大学档案馆 - 成立于2002年9月，由原西校区综合档案室、东校区综合档案室和人事处档案科合并组成。
• 中山大学档案馆 - 广东省特级档案综合管理单位、国家二级科技事业档案管理单位，处级建制。
• 内蒙古农业大学档案馆 - 成立于2001年10月，由内蒙古农牧学院档案科与内蒙古林学院档案科合并组成，属副处级建制。
• 华东师范大学档案馆 - 成立于1988年6月，直属校长领导，是学校档案工作的职能部门和集中管理、提供利用学校档案的基地。
• 华东理工大学档案馆 - 成立于1986年4月，为学校直属单位，正处级建制。
• 华中科技大学档案馆 - 三校合并而成，下设同济医学院综合档案室、协和医院档案室、同济医院档案室、梨园医院档案室、基建档案分室、出版档案分室和设备档案分室。
• 华南理工大学档案馆 - 1958年建立档案科，设出版、声像两个档案分室。
• 南京大学档案馆 - 成立于1986年4月，下设文书档案室、科技档案室、声像档案室、档案馆办公室、史料征集编研室、校史馆管理室、计算机网络室及《学校档案》杂志编辑部等科室。
• 厦门大学档案馆 - 1991年4月成立，为正处级建制单位，属学校档案工作的职能管理部门，又是永久保存和利用本校档案的科学文化事业机构。
• 吉林大学档案馆 - 2000年6月12日组建，是具有部分管理职能的学校直属处级单位。
• 同济大学档案馆 - 1960年成立，集职能管理和科学文化事业机构为一体，负责集中统一管理全校各种门类的档案。
• 哈尔滨理工大学档案馆 - 国家一级档案馆，1996年10月成立。
• 复旦大学档案馆 - 成立于1988年3月，下设五个室。
• 大连海事大学档案馆 - 成立于1997年6月，是学校档案管理工作，保存和提供利用档案信息资源的业务职能部门。馆藏档案分6个全宗。
• 天津师范大学档案馆 - 成立于1999年4月，馆内设办公室、收集整理指导部、保管利用开发部。保管十二个门类的档案，案卷总数３万余卷。
• 对外经济贸易大学校办综合档案室 - 档案室隶属于校长办公室，主要负责全校档案的收集 、整理、 保管、 统计及学历认证工作。
• 山东大学档案馆 - 处级建制，直属校长领导，西校区和南校区分别设综合档案室。
• 山西农业大学档案馆 - 2002年建立，前身山西农学院档案馆。
• 山西大学档案馆 - 成立于1993年，共有12个一级类目和若干个二级类目，档案将近4万卷。
• 广西师范大学档案馆 - 成立于2002年3月，学校直属独立建制的业务单位，既是学校档案工作的职能管理部门，又是永久保存和提供利用本校档案的机构。
• 扬州大学档案馆 - 成立于1998年10月，为副处级直属单位。馆内设党政档案部、科技档案部和技术部。
• 武汉大学档案馆 - 成立于1988年7月，为处级建制。馆内设有监督指导室、档案管理室、技术室、编研室和办公室。
• 浙江大学档案馆 - 始于1911年，馆藏8个全宗，档案计154379卷、72563件。
• 浙江师范大学档案馆 - 1999年9月成立，收藏浙江师范大学、浙江体育学院、浙江师院金华分校、浙江财政学校、杭州幼儿师范学校、金华铁路司机学校六个全宗的档案三万两千余卷。
• 清华大学档案馆 - 成立于1991年10月，馆内设文书档案部、科技档案部、人事档案部和技术部。
• 西北农林科技大学档案馆 - 2000年7月组建，副处级建制，挂靠校长办公室。
• 西安交通大学档案馆 - 1957年3月成立了党政联合档案室，集中统一管理全校的文书档案，1987年4月，成立了正处级建制的档案馆。
• 郑州大学档案馆 - 2001年3月成立,校直属处级机构。现设郑州大学南校区文书档案室、科技档案室、郑州大学工学院档案室、郑州大学医学院档案室4个分室。
• 长安大学档案馆 - 在原西安公路交通大学、西安工程学院西北建筑工程学院三校综合档案室的基础上于2000年6月正式组建为综合档案室，科级建制，2001年3月实现完全合并。
• 长春理工大学档案馆 - 成立于2001年4月，下设综合档案部和人事档案部。
• 陕西师范大学档案馆 - 馆藏档案起始于 1944 年，计有西安师范学院、陕西师范学院、陕西师范大学三个全宗。